A ciência ainda não chegou a uma conclusão sobre como evitar a endometriose. No entanto, ainda que sem garantia de que o problema não aparecerá, é possível apontar algumas medidas preventivas. A primeira delas é manter uma alimentação equilibrada. A fim de evitar substâncias associadas à endometriose, como BPA, dioxina, pesticidas e metais pesados, também é recomendado se afastar ao máximo de áreas com alta concentração de lixo industrial, higienizar com cuidado todos os alimentos e não comer ou beber nada de procedência duvidosa. Além disso, deve-se fugir do estresse, dormir bem, exercitar-se e não fumar.